【學以精工】北理工iGEM亞洲金獎作品(上)——牛奶中抗生素監(jiān)測的新策略
發(fā)布日期:2013-11-01 供稿:宣傳部 學生記者 張夢夢
編輯:宣傳部 閱讀次數(shù): 日前,北京理工大學生命學院BIT、BIT-China兩支學生代表隊參加了在香港中文大學康本學術(shù)科技園舉行的國際遺傳工程機器設(shè)計競賽(iGEM)亞洲區(qū)的決賽,獲得了兩枚金獎的驕人成績,并成功晉級將于2013年11月初在美國麻省理工學院(MIT)舉辦的iGEM-2013世界錦標賽決賽。
iGEM是由美國麻省理工學院2005年創(chuàng)辦的,現(xiàn)已發(fā)展成為合成生物學領(lǐng)域國際性的學術(shù)競賽。競賽要求學生自主選題,設(shè)計并構(gòu)建一個能夠在工程菌(大腸桿菌)中實現(xiàn)表達和操控的生物系統(tǒng),該科研成果將提交給MIT的競賽組委會,供全球的科學家共享,從而使學生的創(chuàng)新成果擁有更為深遠的學術(shù)價值和潛在應(yīng)用價值。
今年亞洲賽區(qū)決賽共有68支隊伍參賽,包括北京大學、清華大學、復旦大學、上海交大、香港科技大學、東京工業(yè)大學、香港中文大學、臺灣陽明大學等亞洲知名大學代表隊在內(nèi)。此項競賽受到 Nature、Science等國際權(quán)威科學雜志,以及 BBC 這樣的傳統(tǒng)媒體的關(guān)注,并進行專題報道,具有非常大的國際影響力。
北京理工大學生命學院圍繞該項比賽進行了認真籌備,不僅向兄弟高校學習調(diào)研,同時結(jié)合我校生命類學生的特點,開展了廣泛動員,并吸收了部分其他專業(yè)學生參與其中,真正體現(xiàn)了我校理工學科雄厚基礎(chǔ)以及生命科學新興交叉學科的活力。
北京理工大學BIT代表隊的21名成員在鄧玉林教授、慶宏教授和馬宏副教授的聯(lián)合指導下,完成了題為《A New Strategy to Detect Antibiotics in Milk: Based on Sensors with Controllable Bio-enhanced Blocks》(牛奶中抗生素檢測的新策略——基于可控生物放大模塊的生物傳感器)的參賽項目。
這一項目立足食品安全,特別關(guān)注食品衛(wèi)生中的抗生素污染問題,抗生素濫用造成的細菌抗藥性已經(jīng)成為威脅人類健康的突出問題。因此,食品中抗生素的檢測更顯得十分急迫。牛奶是其中具代表性的食品,特別是奶牛飼養(yǎng)過程中喂食的抗生素藥品,對牛奶產(chǎn)品形成了直接污染,由于抗生素類物質(zhì)的特殊性,目前缺乏高效率手段進行檢測。本項目設(shè)計,就是以四環(huán)素、β內(nèi)酰胺、六價鉻這三個具有代表性的抗生素類物質(zhì)為對象,通過對大腸桿菌的改造,使之成為具有針對性的生物檢測傳感器。
項目的設(shè)計思路是找到與三種抗生素結(jié)合能形成特定蛋白表達的因子,經(jīng)由一系列蛋白質(zhì)內(nèi)部的反應(yīng),最終實現(xiàn)綠色熒光蛋白的表達,這樣一來,就可以在通過生物芯片技術(shù)實現(xiàn)對熒光值的檢測,從而確定三種抗生素物質(zhì)的存在與數(shù)量。
該項目構(gòu)建了一套完整的生物檢測系統(tǒng),包括一套對特定抗生素有響應(yīng)的感應(yīng)模塊,一套基于T7 RNA聚合酶激活T7啟動子,使T7啟動子具有強活性的放大模塊以及一套基于lacI基因的表達產(chǎn)物控制半乳糖操縱子lacO的調(diào)控模塊。將每個感應(yīng)模塊組裝上放大模塊及調(diào)控模塊后轉(zhuǎn)入到E.coli中形成三種工程菌,并集成在可被后端電子設(shè)備直接檢出熒光值的芯片上,設(shè)計出了小型化手持式熒光酶標儀,實現(xiàn)了對乳制品中四環(huán)素、β內(nèi)酰胺、六價鉻離子的當場檢測,且可通過控制樣品中添加IPTG的量來實現(xiàn)對放大倍率的控制。
BIT代表隊設(shè)計研發(fā)出的該系統(tǒng)不僅適用于牛奶中抗生素的檢測,同樣適用于其他藥物及食品的檢測。該系統(tǒng)不僅將抗生素的檢測帶出了實驗室,降低了抗生素檢測對環(huán)境的要求,降低了檢測成本,設(shè)備小型便攜化的設(shè)計還使其具有了更為廣闊的實際生產(chǎn)應(yīng)用價值。
下圖為BIT代表隊設(shè)計的β內(nèi)酰胺傳感器的示意圖。圖中,BlaR1為可與β內(nèi)酰胺特異性結(jié)合的膜蛋白,BlaI為BlaZ啟動子的抑制子。當BlaR1與β內(nèi)酰胺結(jié)合時,將啟動BlaI的降解機制,從而打開BlaZ啟動子,開啟下游增強型綠色熒光蛋白的表達。
如下圖所示,工程菌熒光表達強度與β內(nèi)酰胺濃度之間呈現(xiàn)出良好的線性關(guān)系,即實現(xiàn)了綠色熒光蛋白速率和數(shù)量的可控表達。
對于首次參加iGEM大賽的隊伍來說,能夠從68支隊伍中脫穎而出,獲得金獎,是指導老師和全體隊員們共同努力的成果,也是北京理工大學歷來重視大學生科技創(chuàng)新建設(shè)的集中體現(xiàn)。合成生物學領(lǐng)域研究在中國還處于起步階段,對于這個嶄新的學科來說,iGEM大賽推動了其在中國的發(fā)展。比賽充分鍛煉了學生的自主創(chuàng)新和團隊協(xié)作能力,為理工學子提供了一個與國際先進研究方向接軌的機會,也為中國合成生物技術(shù)領(lǐng)域人才的培養(yǎng)和高等教育的國際化提供了更為廣闊的空間。下一期我們將介紹另一支獲獎隊伍的創(chuàng)新作品。
(審核:生命學院 馬宏)
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